Flinn se konečně stala plnohodnotnou studentkou ve Světovém expresu – magické internátní škole na kolejích. Teprve se vyrovnává s očekáváním okolí, jež jí předpovídá velké činy, když ve vlaku začnou řádit tajemné stíny a ve škole přestane být bezpečno. Vlak je v ohrožení a zdá se, že právě Flinn je tou, kdo jej může zachránit.
Flinn Nachtigallová je konečne oficiálnou študentkou tajomného internátneho vlaku Svetového expresu. Ťažko však dokáže uveriť, že by jedného dňa mohla zmeniť svet. Rovnako aj jej priatelia Pegs, Kasim a Fedor z toho majú zmiešané pocity. Lenže celý vlak sa zrazu ocitá v nebezpečenstve.
Trinásťročná Flinn Nachtigallová sedáva noc čo noc na opustenej železničnej stanici. Na mieste, kde pred dvoma rokmi bez stopy zmizol jej nevlastný brat. Zostala jej po ňom jediná spomienka – pohľadnica s podivnými veršami a obrázkom starého vlaku, ktorý však nik iný nevidí. V jeden večer tu tento vlak ťahaný mohutným parným rušňom zastaví.
Noc co noc sedává třináctiletá Flinn na opuštěném nádraží, odkud před dvěma lety beze stopy zmizel její nevlastní bratr Jonte. Zůstala jí po něm jen pohlednice s podivnými verši a obrázkem starého vlaku, který ale nikdo kromě ní na pohlednici nevidí. Když pak přesně tento vlak vjede do stanice, hned do něj bez rozmyslu naskočí.