Výsledky svojich početných výskumov publikoval Dušan Halaj najmä vo Vlastivednom zborníku Považia. Ako vedúci odborný pracovník Múzea SNP sa výrazne podpísal pod námety, libretá a scenáre rôznych výstav s tematikou druhej svetovej vojny, ktoré Múzeum v tom čase realizovalo.