I když Cesare Borgia ani Lucrezia nepřežili svého otce papeže o mnoho let, historie rodu Borgiů jejich smrtí neskončila. Naopak, jejich potomci i nadále výrazně zasahovali do evropských dějin. Lucreziin syn se sňatkem spojil s francouzským královským rodem. V dramatických událostech, které v 16.
Roku 1503 zasvěcuje papežský ceremoniář Johannes Burckard mladého klerika do tajemství pontifikátu Alexandra VI. Borgii. Rodrigo Borgia ze španělského šlechtického rodu Llançol y Borja po čtyřicet let pečlivě budoval svou církevní kariéru a stal se nejbohatším a nejmocnějším z kardinálů kurie. Po smrti papeže Inocence VIII.