Komentář je v pořadí třetím vydáním, kdy odstup od předešlého vydání činí téměř 5 let. Za tuto dobu došlo nejenom k několika zásadním novelizacím zákona, leč také ke vzniku mnoha rozhodnutí správních soudů. To je důvodem, proč komentář co do obsahu nabyl o cca jednu třetinu.
Ve druhém vydání publikace Daňový řád. Komentář byly zároveň v mezích možností zohledněny i první poznatky z praxe. Kromě toho došlo i k zásadnímu rozšíření komentáře o recentní judikaturu správních soudů a Ústavního soudu. Byť se stále jedná o judikaturu k původnímu zákonu, je tato s ohledem na podobnost obou norem dobře použitelná.