Šarlatový alchymista Kimblee drží v ruce trumf pokud mu Ed a Al odmítnou poslušnost, odskáče si to nic netušící Winry. Bratři Elricovi se tak chtě nechtě musejí zúčastnit pátrání po uprchlém Scarovi, avšak situace se podstatně komplikuje s příchodem sněhové bouře...
Útok na pevnost je jen jednou z mnoha nepříjemností, které budou muset Edward a Alphons čelit. Spojenci Kinga Bradleyho totiž nelení a plánují získat sestru majora Armstronga na svou stranu. A pokud jejich nabídce neodolá, bude to pro Eda i Ala znamenat konec všech nadějí...
Ed a Al sice vyvázli z Gluttonyho žaludku, ale to neznamená, že mají po starostech. Z vězení totiž uprchl démon z válečného tažení proti Išvaalu – Šarlatový alchymista Solf Kimblee, který má spadeno na Kámen mudrců. A to není zdaleka jediný nový nepřítel, který se objevuje na scéně...
Je čas na malou exkurzi do minulosti. Ed se od poručíka Hawkeye dozvídá, co se vlastně před lety doopravdy událo během občanské války v Išvaalu, a jakým způsobem tehdejší útrapy ovlivnily osudy plukovníka Mustanga a jeho věrných vojáků.
Takové rodinné shledání si bratři Elricovi rozhodně nepředstavovali. Ed a Al ovšem nejsou jediní, koho nečekané odhalení zastihlo nepřipravené. Také Lin se ocitá tváří v tvář pokušení, kterému nelze odolat. Převládne přátelství... či touha po nesmrtelnosti?
Bitva s homunkuly se rozhořela na dvou frontách. Zatímco Ed a Al bojují s Gluttonym, plukovník Mustang spolu se svými věrnými vojáky vyráží do útoku proti vrchnímu veliteli Bradleymu. Co bude nakonec nebezpečnější? Gluttonyho nenasytný žaludek, nebo úskalí vysoké politiky? To se naši hrdinové už brzy dozvědí...
Věci se dávají do pohybu, ovšem ne pro každého se situace vyvíjí dobře. Uvnitř armády to vře, Winry dohánějí stíny minulosti a boj s homunkuly nabírá na intenzitě. Plukovník Mustang má ovšem plán, jak se nepřátelům dostat přímo do týlu...
Hohenheim se po mnoha letech vrátil do Resemboolu, ale nedá se říct, že by na něj jeho synové čekali s otevřenou náručí. Jeho přítomnost v Edwardovi navíc vyvolává nepříjemné vzpomínky a zároveň pochybnosti, se kterými nebude snadné se vypořádat...
Porcovač Barry sice není příliš kladný hrdina, avšak to mu na důležitosti neubírá. Jeho vědomosti o pokusu vyrobit Kámen mudrců jsou totiž nesmírně cenné a plukovník Mustang tak musí udělat vše, co je v jeho silách, aby jej ochránil před homunkuly.
Ed i Al se vrací do hlavního města na velitelství, ale čekají tu na ně jenom špatné zprávy. Plukovník Maes Hughes byl zavražděn… a hlavním podezřelým je Maria Ross. A venku zatím řádí oživlý sériový vrah, tajemný homunkulus a voják posedlý pomstou…
Záchranná mise skončila masakrem, do kterého musela zasáhnout i armáda. Zatímco se Ed a Al vyrovnávají s následky svých činů, přijíždí do města dvojice cizinců. Překročili velkou poušť a přišli si pro Kámen mudrců
Kde byl Alphons Elric tu krátkou chvíli, co byl vymazán z existence? Kde byla jeho duše? Když bratra unese tajný spolek, který se snaží odhalit alchymistické tajemství jeho stvoření, je na Edovi (a jisté ženě v domácnosti) aby se vypravili přímo do jámy lvové a bratra zachránili.
Jak se Ed vlastně stal slavným Ocelovým alchymistou? Vzpomínání na náročný a nesmlouvavý výcvik v domě paní učitelky Izumi i na první setkání s budoucím plukovníkem Mustangem se na první pohled může zdát jako pouhé nostalgické ohlédnutí... jenže co když se klíč k nalezení Kamene mudrců nalézá právě v Edově minulosti?
Bratři Elricovi se konečně setkávají se svou starou učitelkou a ukáže se, že jejich obavy byly na místě – skutečně je nevidí dvakrát ráda a její přesvědčení navíc napovídá, že jim nebude ochotna s hledáním kamene mudrců pomoci. Winry zatím náhodné střetnutí se zlodějem přivede na stopu mechanika, který s automailem dokáže pravé zázraky.
Edward a Al se vrací domů, aby se zotavili po těžkém boji. To ovšem neznamená, že jejich pátrání po kameni mudrců končí – právě naopak. Za přispění majora Armstronga se Edward o tomto alchymistickém svatém grálu dozvídá i něco, co možná nikdy nechtěl vědět.
Edwarda Elrica nezajímá nic jiného, než jak svému bratru Alphonsovi vrátit jeho původní tělo, o které přišel při nebezpečném alchymistickém pokusu. Zároveň je však státním alchymistou, a proto mu nezbývá než krátce přerušit svou pouť a věnovat se služebním povinnostem.
Základní pravidlo alchymie zní – abyste něco získali, musíte obětovat něco stejné hodnoty. O tom, že se toto pravidlo nevyplácí porušit, se mladí alchymisté Edward a Alphons Elricovi přesvědčili na vlastní kůži. Jeden přišel o ruku a nohu a druhý se stal jen duší uvězněnou ve zbroji. Nyní putují světem a hledají způsob, jak to všechno napravit.