Ruby je teď plnohodnotnou členkou Spektra, utajené organizace plné zvláštních agentů. Další šifry čekají na to, až je rozlouskne, ale zároveň se musí potýkat také s běžnou školní docházkou a předstírat, že je vlastně obyčejná dívka. Na super chytrou a vždy klidnou Ruby tentokrát čekají piráti i příšera z hlubin oceánu.